質(zhì)譜儀又稱(chēng)質(zhì)譜計，進(jìn)行質(zhì)譜分析的儀器，即根據帶電粒子在電磁場(chǎng)中能夠偏轉的原理，按物質(zhì)原子、分子或分子碎片的質(zhì)量差異進(jìn)行分離和檢測物質(zhì)組成的一類(lèi)儀器。

    質(zhì)譜儀以離子源、質(zhì)量分析器和離子檢測器為核心。離子源是使試樣分子在高真空條件下離子化的裝置。電離后的分子因接受了過(guò)多的能量會(huì )進(jìn)一步碎裂成較小質(zhì)量的多種碎片離子和中性粒子。它們在加速電場(chǎng)作用下獲取具有相同能量的平均動(dòng)能而進(jìn)入質(zhì)量分析器。

    質(zhì)譜分析手段在過(guò)去的十年中飛速發(fā)展，目前這種分析手段的應用幾乎遍及每個(gè)角落。尤其是在生命科學(xué)領(lǐng)域中，質(zhì)譜分析已經(jīng)成為蛋白質(zhì)以及小分子應用中*的一種分析手段。

    從技術(shù)的角度來(lái)說(shuō)，大部分的質(zhì)譜儀都無(wú)法獲得所需要的所有信息，因此必須同時(shí)應用兩種或更多的檢測手段來(lái)達到*大的靈敏度和生產(chǎn)能力。

    對于某些應用來(lái)說(shuō)，由于產(chǎn)物離子的靈敏性通常情況下不是很強，因此想要通過(guò)三倍的四極矩設備來(lái)獲得高質(zhì)量的譜圖是非常困難的。這種靈敏性上的欠缺可以通過(guò)QqTOF技術(shù)來(lái)克服，這種技術(shù)能夠提供附加的質(zhì)譜信息，但是真實(shí)的前體和中性損失掃描實(shí)驗以及可信賴(lài)的定量分析就很難實(shí)現了。盡管離子阱質(zhì)譜儀（MS）可以實(shí)現多次敏感的質(zhì)譜（MSn）實(shí)驗，從而弄清楚反應機理，簡(jiǎn)化光譜的干擾。

    但是前面的問(wèn)題對于三維離子阱技術(shù)來(lái)說(shuō)同樣無(wú)法避免。盡管如此，三維離子阱很容易發(fā)生過(guò)載現象（空間充電效應），這種現象可能導致質(zhì)量漂移，分解損失以及光譜和校準曲線(xiàn)的非線(xiàn)性。因此，三維離子阱不適用于較大量的分析。所有這些在**代混合線(xiàn)性離子阱/三倍四極質(zhì)譜儀開(kāi)發(fā)出以后都得到了改變，來(lái)自Applied Biosystems 和MDS SCIEX公司的Q TRAP LC/MS/MS系統，是在A(yíng)PI 2000 LC/MS/MS平臺的基礎上開(kāi)發(fā)出來(lái)的，產(chǎn)品已經(jīng)投放市場(chǎng)，馬上受到蛋白質(zhì)以及藥物開(kāi)發(fā)質(zhì)譜儀領(lǐng)域的廣泛歡迎。